Graphitix : une alternative gratuite et open-source à Prism pour les graphiques scientifiques
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Graphitix est une application web gratuite et open source destinée à l’analyse et à la visualisation de données scientifiques, développée par Michel Wassef (Inserm, Institut Curie).
Elle permet d’importer des données, de réaliser des analyses statistiques, de produire des graphiques et d’exporter les figures, sans installer de logiciel.
Graphiques et statistiques au même endroit
Graphitix couvre les principaux graphiques utilisés en analyse scientifique : scatter plots, box plots, violin plots, histogrammes, heatmaps, courbes, visualisations 3D, etc.
L’application intègre également de nombreuses analyses statistiques : tests de comparaison, ANOVA, corrélations, régressions, PCA, clustering, ROC/AUC, Kaplan-Meier, t-SNE, UMAP, volcano plots…
Les données, les paramètres d’analyse et la mise en forme des graphiques peuvent être conservés dans un même projet .graph.
Une alternative gratuite et opensource à Prism et Origin
Le positionnement est proche de celui de GraphPad Prism : partir d'un tableau de données et obtenir à la fois une analyse statistique et une figure exploitable pour une publication.
La différence principale est le modèle de distribution. Graphitix est gratuit, open source (MIT) et accessible directement depuis un navigateur.
Il peut également constituer une alternative légère à Origin/OriginPro pour les besoins courants de visualisation et d'analyse.
En revanche, R, Python, OriginPro ou JMP restent plus adaptés aux analyses très spécialisées, aux traitements automatisés et aux workflows complexes.
Pas besoin de passer par cinq logiciels
Un workflow courant peut ressembler à :
Excel → analyse statistique → graphique → export → retouches
Graphitix regroupe ces opérations dans une même application :
données → analyse → graphique → export
Les figures peuvent être exportées notamment en SVG et PNG, ce qui permet de les intégrer directement dans des articles ou des présentations.
Une application web et open source
Graphitix fonctionne uniquement côté client. Les données utilisées pour les analyses courantes n'ont donc pas besoin d'être envoyées à un serveur et restent sur l'ordinateur de l'utilisateur. L'application ne demande pas non plus de créer un compte et aucune donnée n'est partagée, ni même collectée.
L'application peut être utilisée en ligne ou localement. Le code source est disponible sur GitHub sous licence MIT.
👉 Code source de Graphitix sur GitHub
Pour qui ?
Graphitix s'adresse principalement aux chercheurs, étudiants et ingénieurs qui ont besoin de produire régulièrement des graphiques scientifiques et des analyses statistiques sans nécessairement passer par R, Python ou un logiciel commercial spécialisé.
Pour les besoins courants, il offre une alternative simple à un workflow basé sur Excel + Prism/Origin + logiciel de retouche graphique.